Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
InipQ3TXT3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms