Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt2Q3TTY5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms