Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms