Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38aQ3TMP8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms