Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca4Q3TKT4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms