Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc13Q3TIR1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms