Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r11Q3SXA2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r11Q3SXA2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms