Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdss2Q33DR3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdss2Q33DR3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms