Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl1Q2VPR5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms