Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp8Q2V6D6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms