Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shroom4Q1W617 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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Shroom4Q1W617 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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Shroom4Q1W617 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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