Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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