Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lingo4Q149C3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms