Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2b3Q0VF55 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms