Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rundc1Q0VDN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms