Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnnm1Q0GA42 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnnm1Q0GA42 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.3 ms