Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q08AU9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q08AU9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q08AU9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q08AU9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms