Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms