Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms