Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms