Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Larp7Q05CL8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms