Protein–RNA interactions for Protein: Q05920

Pc, Pyruvate carboxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcQ05920 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PcQ05920 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PcQ05920 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcQ05920 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcQ05920 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcQ05920 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcQ05920 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcQ05920 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms