Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox12Q04890 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms