Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox10Q04888 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox10Q04888 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms