Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms