Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp11Q02853 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms