Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col6a2Q02788 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms