Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms