Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GscQ02591 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GscQ02591 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GscQ02591 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GscQ02591 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms