Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdcd1Q02242 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms