Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms