Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms