Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Top2aQ01320 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms