Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms