Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms