Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms