Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms