Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms