Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AlkP97793 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AlkP97793 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AlkP97793 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AlkP97793 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AlkP97793 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AlkP97793 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AlkP97793 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
AlkP97793 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms