Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cmklr1P97468 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cmklr1P97468 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms