Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms