Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms