Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptprn2P80560 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptprn2P80560 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms