Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cct5P80316 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms