Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms