Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9xP70398 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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