Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx1P70314 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx1P70314 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms