Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms