Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf6P70196 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms