Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms